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Suzana Hadjur가 이끄는 네임드카지노 조직 및 기능 연구 그룹은 포유 동물 세포에서 유전자 발현을 제어하는 기본 메커니즘을 이해하는 데 중점을 둡니다.
Contact
Suzana Hadjur 교수
그룹 리드
Wellcome Trust Senior Research Fellow
이메일 :s.hadjur@ucl.ac.uk
Lab 204, Paul O'Gorman Building
72 Huntley Street
런던, WC1E 6BT
네임드카지노
유전자 발현의 공간적 및 시간 제어는 복잡한 다세포 유기체의 발달에 필수적이다. 부적절한 유전자 활동은 발달 이상과 암으로 이어집니다.
우리는 두 가지 관련 질문을 조사하고 있습니다 :
- 3 차원 염색체 구조가 유전자 발현에 어떤 영향을 미칩니 까?
- 정상 및 암 발달 동안 절연체 단백질, 코 헤신 및 CTCF가 세포-특이 적 유전자 프로그램에 어떤 영향을 미칩니 까?
진핵 생물 네임드카지노은 기저 세포 상태를 반영하는 특정 방식으로 3 차원 (3D) 핵 공간으로 구성됩니다. 고유 3D 형태의 염색체를 '포착'하도록 설계된 분자 방법의 출현으로 염색체 구조와 네임드카지노 기능 사이의 관계에 대한 우리의 이해는 빠르게 변화하고 있습니다.
코 헤신은 염색체 토폴로지에서 근본적인 역할을하는 고대 및 필수 단백질 복합체입니다. 코 헤신과 그 조절제의 결함은 인간 암의 염색체 잘못 분리에 대한 책임이 점차 인식되고 있으며, 발달 장애의 원인으로, 광범위한 유전자 규제 완화로 인한 것으로 생각됩니다.
우리는 모델 시스템으로 뇌 줄기 세포와 기유 후 자손을 사용합니다. 우리는 높은 처리량 실험 및 유전체학 방법과 계산 분석 (HI-C, 4C-SEQ, ChIP-SEQ)을 유전자 도구 및 단일 세포 현미경과 결합하여 코헤신-매개 핵 구조가 세포 상태의 근본적인 발현을 조절하는 방법을 조사하는 다 분산 접근법을 취한다.
네임드카지노 하이라이트는 1) 유사 분열 조절제 코 헤신이 유전자 발현을 조절할 수 있다는 발견; 2) 코 헤신이 유전자 활성을 조절하기 위해 원위 DNA 요소들 사이의 의사 소통을 촉진한다는 발견;
우리는 현재 코 헤신-매개 핵 구조가 마우스에서 줄기 세포 분화 동안 유전자의 조절에 어떤 영향을 미치는지 네임드카지노하고있다. 우리는 크로마틴의 토폴로지 형태가 전사 인자와 협력하여 계보 약속을 주도하는 방법에 대한 포괄적 인 이해를 구축하기 위해 고유 한 유전자 도구와 정교한 시스템을 개발하고 있습니다.
세포 분화의 부패는 또한 암의 특징입니다. 암 줄기 세포가 어떻게 발달하는지 이해하는 것이 매우 중요합니다.
그림 1- 코 헤신/CTCF- 매개 상호 작용의 고해상도 4C-seq 분석. 대조군 (LOX/LOX) 또는 코 헤르 신- 결핍 세포 (Δ/δ)의 두 가지 다른 네임드카지노 영역에서 코 헤신/CTCF 부위에 고정 된 미끼 (검은 반점)의 4C-seq 프로파일.
그림 2- 코 헤신 결핍 세포는 글로벌 염색체 도메인 분해 및 핵 부피 증가를 경험합니다. 3 세트의 어류 프로브는 염색체 영역의 경계에 설계되었으며 빨간색 또는 녹색으로 표시되었습니다.
그림 3- 배향 된 CTCF 모티프는 CTCF- 매개 상호 작용의 방향성을 결정합니다. CTCFS 결합 모티프의 배향에 따라 그룹화 된 보존 된 CTCF 결합 부위에 대한 MMU 및 CFAM 네임드카지노 모두에서의 평균 접촉 단열 분석.
그림 4- 비교 HI -C는 CTCF가 염색체 도메인 아키텍처의 진화의 기초가 있음을 보여줍니다. 염색체 도메인 구조의 진화의 기초가되는 메커니즘을 탐구하기 위해, 우리는 4 개의 포유 동물 종을 비교하고 절연체 부위 발산과 염색질 도메인 구조의 진화 사이의 직접적인 연관성을 밝혀냈다.
선정 된 간행물
- Pezic D, Weeks Sl, Hadjur S (2017).눈을 충족시키는 것보다 코헤신에 더 많이 : 네임드카지노의 미세 조정을위한 복잡한 다양성. 유전학 및 개발에 대한 현재 의견2017 년 4 월; 43 : 93-100.
- Barrington C, Finn, R, Hadjur S (2017).코 헤신 생물학은 루프 압출을 충족합니다. 염색체 네임드카지노2017 년 3 월; 25 (1) : 51-60.
- Uusküla-Reimand L, Hou H, Samavarchi-Tehrani P ... Hadjur S, et al (2016).Topoisomerase II 베타는 토폴로지 도메인 테두리에서 코 헤신 및 CTCF와 상호 작용합니다. 네임드카지노 생물학. 8 월 31:17 (1) : 182-86
- Vietri-Rudan M, Hadjur S and Sexton T (2016).염색체 형태 캡처에 의한 공간 염색질 조직 탐지 : HI-C에 의한 네임드카지노 전체 프로파일 링. 행동 양식. 분자 생물학의 방법. 2 월 23 일
- Vietri-Rudan M and Hadjur S (2015).유전 적 재단사 -CTCF와 코 헤신 진화 동안 네임드카지노을 형성합니다. 유전학 동향. 11 월 : 31 (11) : 651-60.
- Vietri-Rudan M, Barrington C, Henderson S ... Hadjur S (2015).비교 HI-C는 CTCF가 염색체 도메인 아키텍처의 진화의 기초가 있음을 보여줍니다. 셀 보고서. 2 월 23 : 1-14
- Sofueva S, Yaffe E, Chan WC, Georgopoulou D ... Hadjur S (2013).코 헤신은 간기 염색체 구조를 안정화시킵니다. Embo J. 12 월 11 일;
- Martynoga B, Mateo JL, Zhou B ... Hadjur S 등 (2013).후성 유종 강화제 주석은 신경 줄기 세포 quiescence에서 NFIX의 주요 역할을 보여줍니다. Genes Dev. 8 월 15 : 27 (16) : 1769-86.
- Sofueva S and Hadjur S (2012).코 헤신 매개 염색질 상호 작용-유전자 조절의 3 차원으로의. 네임드카지노 유전체학 브리핑. 5월;
- Hadjur S, Ryan NK, Williams LM, Cobb BS 등 (2009).코헤 신은 발달 조절 IFNG 유전자좌에서 염색체 시스 인터랙션을 형성합니다. 자연. 7 월 16 일; 460 (7253) : 410-3.
그룹 멤버
- Dr Christopher Barrington
- Dr Stanimir Dulev
- Dr Ron Finn
- Dr Dubravka Pezic
- MS Hayley Porter
- Dr Wazeer Varsally
- Mr Samuel Weeks
Funders
