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Jasmin Fisher Lab은 암 진화 및 암 환자를위한 더 나은 개인 치료를 식별하기위한 암 진화 및 치료 메커니즘을 연구하기위한 계산 볼트카지노 및 분석 기술을 개발합니다.
그룹 리더
Jasmin Fisher 교수, PhD, FRSB
전산 볼트카지노 교수
이메일 :jasmin.fisher@ucl.ac.uk
전화 : +44 207 679 6882
PA : Shelley McDonald
이메일 :s.mcdonald@ucl.ac.uk
전화 : +44 207 679 6304
연구 초점과 미션
우리의 연구는 정상적인 발달 및 질병 모두 동안 세포-사면 결정 프로그램을 뒷받침하는 분자 메커니즘의 식별을 통해 암이 어떻게 진화하는지 이해하는 데 중점을두고 있습니다. 우리는 Executable Biology라는 혁신적인 접근법을 개발했으며, 이는 컴퓨터 프로그램 인 것처럼 볼트카지노적 메커니즘을 시뮬레이션하고 분석하는 도구입니다.
우리의 목표는 발암 신호 경로가 암의 시작, 진행, 유지 및 (차단 될 때) 회귀를 조절하는 기계적인 프로그램을 결정하는 것입니다. 우리는 발암 성 신호 네트워크의 계산 볼트카지노링과 세포 운명 결정 (예 : 증식 및 세포 사멸)과 관련된 방법에 의해이를 수행합니다.
실험 실험실 작업과 계산 볼트카지노링 사이의 반복주기.
PNAS 116 (44) : 22399-22408, 2019
실험실
캠브리지 대학의 생화학과에서 10 년이 지난 후, 실험실은 최근 UCL 암 연구소로 이사하여 연구소 내에서 의료 및 임상 종양 전문의 및 암 볼트카지노 학자의 뛰어난 재능과의 협력을 강화했습니다.
우리의 다 분야 실험실은 다양한 배경 (예 : 생물학, 물리학, 컴퓨터 과학, 소프트웨어 공학, 의학)의 학생, 박사후 연구원을 호스트합니다. 우리는 실험 암 생물 학자 및 임상의와 긴밀히 협력하여 계산 볼트카지노을 구축하고 분석하고 실험적으로 예측을 검증합니다.
선정 된 간행물
- Howell R, Davies J, Clarke MA, Appios A ... Fisher J, Bennett CL.실행 가능한 볼트카지노링을 통해 해독 된 피부에서 1 차 흑색 종의 국소 면역 감시. 공상 과학 Adv.
- Howell R, Clarke MA, Reuschl AK, Chen T ... Fisher J.SARS-COV-2- 호스트 상호 작용의 실행 가능 네트워크 약물 조합 치료 예측. NPJ Digit Med.
- Clarke MA, Fisher J.실행 암 볼트카지노 : 성공 및 도전. Nat Rev 암.
- Kreuzaler P, Clarke MA, Brown EJ ... Fisher J.유방암에서 MYC 발현의 이질성은 실행 가능한 기계 볼트카지노링을 통해 공개 된 약리학 적 취약성을 폭로합니다. Proc Natl Acad Sci U S A. 2019 년 10 월 29 일; 116 (44) : 22399-22408.
- Yu MK, Ma J, Fisher J, et al.생체 의학에 대한 가시 머신 러닝. 셀.
- Silverbush D, Grosskurth S, Wang D ... Fisher J.급성 골수성 백혈병에서 PIM 경로의 세포 별 전산 볼트카지노링. 암 res.
- Chuang R, Hall BA, Benque D ... Fisher J.혁신적인 계산 플랫폼을 사용한 만성 골수성 백혈병의 약물 목표 최적화. Sci Rep. 2015 년 2 월 3 일; 5 : 8190.
- Moignard V, Woodhouse S, Haghverdi L ... Fisher J, Göttgens B.단일 세포 유전자 발현 측정에서 조기 혈액 발달의 조절 네트워크 디코딩. Nat Biotechnol.
- Nusser-Stein S, Beyer A, Rimann I ... Fisher J.C. el. Mol Syst Biol.
- Fisher J, Henzinger TA.실행 가능한 세포 볼트카지노. Nat Biotechnol.
계산 도구
바이오 볼트카지노 분석기
BIO 볼트카지노 분석기 (BMA)는 신호 전달 경로를 설명하고 세포 안정화를 결정하는 생물학적 볼트카지노링 도구입니다. 이 도구는 시스템 생물학, 공식적인 방법, 인간 컴퓨터 상호 작용 및 설계의 관점을 병합하는 것을 나타냅니다.
단일 셀 네트워크 합성 도구
단일 셀 네트워크 합성 도구 (SCNS)는 단일 세포 유전자 발현 데이터에서 실행 가능한 볼트카지노의 재구성 및 분석을위한 도구로, 웹 기반 그래픽 인터페이스를 통해 성능 및 제어를 위해 클라우드에 계산을 쉽게 배포하는 것을 지원합니다. SCN은 차별화, 발달 또는 재 프로그래밍 여행을 이해하는 데 사용될 수 있습니다.
공동 작업자
- 장 아브라함(케임브리지 대학교 종양학 부)
- Clare Bennet(UCL Cancer Institute, Royal Free Hospital)
- Jyoti Choudhary(암 연구소)
- 벤 홀(Dept. Medical Physics & Biomedical Engineering, UCL)
- Greg Hannon(Cruk Cambridge Institute)
- Steve Jackson(Cruk Cambridge Institute)
- Richard Mair(Cruk Cambridge Institute)
- Nicky McGranahan(UCL 암 연구소)
- Nir Piterman(고센 버그 대학교 컴퓨터 과학)
- Maria Secrier(Dept. Genetics, UCL)
기능 : 컴퓨터 볼트카지노은 초기 단계의 피부암이 면역 세포에 '보이지 않는'상태를 유지할 수있는 방법을 보여줍니다
Jasmin Fisher와 Clare Bennett이 이끄는 연구는 신체의 면역 체계에 의해 흑색 종이 어떻게 감지되지 않는지를 보여줍니다. 결과는 질병을 치료하기위한 새로운 약물 조합을 식별하는 방법을 제공합니다.
Funders
