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파라오 슬롯은 우리의 새로운 초기 탐지 전략의 민감도와 특이성을 향상시키기 위해 딥 러닝 방법론과 전용 최첨단 이미징과 결합하는 글로벌 리더입니다.
조기 파라오 슬롯 연구를위한 계산 자원
파라오 슬롯 ACED 센터에는 신경망 교육을위한 전용 GPU 리소스가 있습니다. 그들은를 통해 접근 할 수 있습니다.파라오 슬롯 컴퓨터 과학 고성능 컴퓨팅 클러스터.
사용 가능한 GPU 리소스
- 24 GB GPU 메모리가있는 Nvidia Quatro RTX6000 GPU
- 8 NVIDIA Quadro RTX8000 GPU 48 GB GPU 메모리
- 12 NVIDIA A100 GPU 40GB GPU 메모리
- 40+ NVIDIA RTX A6000 (Ampere Architecture) 48GB GPU 메모리가있는 GPU (아직 사용할 수 없음)
이러한 리소스를 사용하려면 Bash 및 Secure Shell (SSH)의 기본 교육이 필요합니다. 사용자는 파라오 슬롯 CS 기술 지원 그룹이 제공하는 클러스터 유도에 참석해야합니다.
이 리소스 사용에 관심이 있거나 요구 사항에 대해 더 자세히 논의하려면 Yaozhi Lu (LU) (에게 문의하십시오.yz.lu@파라오 슬롯.ac.uk).
이미징 기술 및 전문 지식
전용 연구 스캐너
- 3T MRI 스캐너, PET-MRI, SPINLAB GE HYPERPARORISER, LONDON 7T MRI CENTER에 대한 액세스, 새로운 이미징 트레이서 제조 전용 GMP 시설
- 전용 임상 등급 MRI 스캐너 전 전임상 과학자를 대상으로 사용할 수 있습니다
Cruk National Cancer Translational Accelerator (NCITA)인프라
- 관리 및 주석이 달린 이미징 코호트를 공유하는 다중 센터 이미지 저장소
- 이미지 획득 표준 및 처리에 대한 합의 설정
가상 질병 프레임 워크
Reanimate
theReanimate프레임 워크는 고급 생체 내 및 생체 내 영상화와 수학적 모델을 결합하여 종양 및 조직 미세 환경의 가상 3D 재구성을 만듭니다. Reanimate는 종양 혈류 시뮬레이션 및 생물학적 체액의 수송 및 조직 미세 구조와의 복잡한 상호 작용을 허용합니다.
VERDICT-MRI
the판결(종양에서 세포 측정법에 대한 혈관, 세포 외 및 제한된 확산) 프레임 워크는 생체 내에서 종양의 조직 학적 특징을 정량화하고 맵핑한다. 수학적 모델링은 MR 신호를 세포 크기, 밀도 및 혈관과 같은 미세 구조 조직 특징과 관련하여 조직 학적 특징의 비 침습적 추정치를 제공한다.e.panagiotaki@파라오 슬롯.ac.uk.
우리의 이미징 전문 지식 외에도 독특한 암 코호트는 세 가지 원칙 속성으로 특징 지어집니다. 각 코호트 :
- 소설 초기 암 파라오 슬롯 전략을 탐색
- 이미징 및 바이오 마커의 증분 유용성을 평가
- 는 다운 스트림 임상 결과와 연결되어 있습니다.
조기 파라오 슬롯 코호트
파라오 슬롯 ACED 센터는 이러한 코호트를 렌더링하기 위해 최선을 다할 것입니다공정 준수따라서 조기 파라오 슬롯 연구를 가속화하기 위해 Alliance Partners가 완전히 이용할 수 있습니다.
- Promis (전립선)
thePromis Study| MP-MRI (Multi-Parametric MRI)는 전립선 특이 적 항원 수준이 높아진 남성의 경과 초음파 유도 생검과 비교하여 임상 적으로 유의 한 전립선 암을 검출하는 데 두 배나 우수하다는 것을 보여 주었다 (.Ahmed et al. Lancet 2017).
PROMIS는 전립선의 MP-MRI와 5mm 템플릿 전립선 생검 (기준 표준) 및 12- 코어 초음파 초음파 대기 생검을받은 독특한 남성 코호트 (n = 740)로 구성됩니다.
PROMIS 코호트는 5mm 템플릿 샘플링의 엄청난 부담을 감안할 때 재현되지 않을 것입니다. 이는 AI를 사용하여 영상과 병리 (완전히 디지털화되는 과정) 사이의 연관성을 탐색 할 수있는 매우 중요한 역사적 자원을 나타냅니다.
PROMIS 데이터 세트
PROMIS 연구에서 576 명의 개인에 대해 비 식별 및 가명화 된 데이터 세트를 사용할 수 있습니다
- 전립선 MP-MRI (DICOM)
- 임상 MR 이미징 보고서 (PDF)
- 조직 병리학 보고서 (PDF)
- 가문화 임상 데이터 (CSV)
연구 목적으로 이러한 데이터 세트에 대한 액세스는 Reimagine Trial Management Group에 응용 프로그램이 필요합니다.reimagine@파라오 슬롯.ac.uk자세한 내용.
- 혁신 (전립선)
혁신전립선 암으로 의심되는 3 년 동안 모집 된 365 명의 남성 코호트로 구성됩니다. 이 코호트는 혈청과 비뇨기 바이오 마커를 상세한 조직 병리학 및 표준 및 향상된 MRI 서열 (다중 변수 MRI, 평결 MRI 및 관강 인덱스 MRI)을 결합한 독특한 전향 적 코호트를 나타냅니다.Johnston et al. BMC Cancer 2016).
- Reimagine (전립선)
Reimagine전립선 암 위험은 전립선 암에 대한 의심으로 2 차 치료를 언급 한 남성에 대한 다중 센터, 전향 적, 관찰 적, 종단 코호트 연구입니다. 이 연구의 목표는 전립선 암 위험에 처한 남성을위한 강력한 기준 위험 계층화 시스템을 개발하는 것입니다.
- ucktocs (난소)
theukctocsLongitudinal Women 's Cohort (UKLWC)는 세계 최대의 무작위 대조 시험 중 하나 인 OKCTOCS (UKCTOCS)의 영국 공동 작업 과정에서 제작 된 생물 소스입니다. 일반 인구의 202,638 명의 여성이 2001-2005 년 사이에 재판에 가입했습니다.
자세한 내용은 Dr Dr Sophia Apostolidou에 문의하십시오 :s.apostolidou@파라오 슬롯.ac.uk.
- Adepts (신경 내분비 및 췌장)
theAdepts Study(췌장암 영국 (CI SP, Nov 2018-APR 2021)이 자금을 지원하는 신경 내분비 및 췌장 종양의 가속화 된 진단). 췌장암 발병의 유전 적 위험.
현재까지, 우리는 임상 데이터와 함께 1,500 개 이상의 소변 및 혈액 샘플을 수집했으며, 이는 이미 추가 자금 조달 및 새로운 결과를 가져 왔습니다 (예 : Immunovia AB, Lund, Sweden. Immunovia AB, Sweden. PDAC의 초기 검출에 대한 다중 센터 조사 연구에 대한 다중 센터 조사 연구.
자세한 내용은 문의 : Stephen Pereira 교수stephen.pereira@파라오 슬롯.ac.uk또는 Dr Pilar Acedo,p.nunez@파라오 슬롯.ac.uk. 지저귀다@pereiragroup
- 서밋 (폐)
theSummit Study는 폐암 발병 위험이 높은 25,000 명의 개인을 모집하는 것을 목표로하는 전향 적 코호트 연구입니다. 이 연구는 University College London (파라오 슬롯), University College London Hospitals (파라오 슬롯H)와 Grail Inc의 협력입니다.